“中國應加大在生物芯片研發方面的投資力度，實現強強結合，盡快建立生物芯片工程研究中心，迅速研究開發出一批具有我國自主知識產權的專門技術，積極參與到國際競爭的行列中去。”2000年2月29日，程京在為國務院及有關部委領導作報告時如此呼吁。
    他的建議引起了國家對生物芯片技術的高度重視。2000年9月30日，北京博奧生物芯片有限責任公司正式成立，并承擔起生物芯片北京國家工程研究中心的投資建設和運營管理任務。
    作為博奧生物總裁兼技術總監、生物芯片北京國家工程研究中心主任，程京沒有辜負期望。自2002年1月承擔了國家“863”功能基因組和生物芯片重大專項生物芯片的研究與開發課題后，他帶領課題組成員經過三年研發，終于圓滿完成規定任務，建立了與我國生命科學研究、醫藥研究及生物技術發展密切相關的生物芯片系統技術平臺，為我國的生命科學基礎研究、新藥開發、醫學診斷和生物檢測等行業提供了有力的核心技術支撐和產品服務，為我國生物芯片制作裝備及檢測儀器的產業化打下了基礎，實現了我國生物芯片從無到有，從弱到強的飛躍。
    5項產品將實現規模化出口
    “生物芯片技術是在后基因組和蛋白質組學時代的一個關鍵性技術，在未來的生物醫學和生物檢測應用方面都有廣泛的前景。生物芯片平臺是一套綜合的技術和知識體系，它除了生物芯片本身以外，還需要配套的生物材料、儀器設備、生物信息學軟件系統等的支持。這包括分子生物學、光機電和力學、材料學、醫學等各種相關學科的知識，是目前生物學研究中最復雜的一項。”程京介紹說。他表示，博奧生物經過6年來的努力，已經建成了“生物芯片，生命科學儀器，軟件與數據庫，生物試劑與耗材”四大系列共計100多項產品和服務。截至2005年9月，博奧生物已經有5項產品開始進入美國、歐洲、日本和韓國等生命科學主要市場，并在2006年實現規模化的出口。博奧生物應用自有技術和知識，正與國際的基因芯片公司Affymetrix合作，研制和生產下一代基因芯片掃描儀。
    經過幾年的努力，博奧生物已經開發出了包括基因分型芯片、表達譜芯片、蛋白芯片和細胞芯片的一系列具有自主知識產權的微陣列核心技術。博奧生物構建了各種cDNA和寡核苷酸文庫及預制芯片以及按照基因功能分類的6類微陣列生物芯片產品，其中包括世界的HLA基因分型芯片；家蠶寡核苷酸微陣列芯片；可用于多種自身免疫性疾病的快速鑒別檢測、為臨床醫生提供更豐富的輔助診斷信息的自身免疫疾病檢測芯片；用于細胞電生理檢測的細胞電旋轉檢測芯片和神經細胞網絡電生理監測芯片等多種芯片產品、覆蓋臨床絕大多數革蘭氏陽性細菌及其重要的耐藥基因；可同時進行細菌鑒定與耐藥基因檢測的細菌鑒定與耐藥檢測基因芯片以及可檢測近20種重要致病性分枝桿菌和針對5種抗結核“一線藥物”的42種常見耐藥基因類型的分枝桿菌菌種鑒定和結核耐藥性檢測基因芯片。
    食品安全芯片檢測系統填補國際空白
    除研發以外，程京還非常注重讓產品更好地服務于市場。
    “我們通過自己的研發，結合客戶的市場需求，開發出系統解決方案。”他說，“比如專門針對食品安全檢測開發的獸藥殘留檢測蛋白芯片和人體內興奮劑檢測蛋白芯片，從樣品處理、芯片設計、檢測儀器到檢測軟件，整套系統都是我們自己開發的，分別獲得了zhuanli保護，并填補了國際芯片檢測領域的空白。”
    據他介紹，獸藥殘留檢測蛋白芯片代產品已通過了國家質檢總局組織的專家鑒定和驗收，該試劑盒可在三小時內對待檢樣品中多種獸藥同時進行殘留檢測，是一種高效的獸藥殘留初篩分析工具。目前已經研制出能夠檢測磺胺類、喹諾酮類等9種獸藥殘留的第二代蛋白芯片，每套試劑盒可檢測24個樣品。通過對大量實際樣品的檢測表明，獸藥殘留蛋白芯片檢測平臺系統操作簡單、檢測速度快、檢測通量高，能在同一張芯片上并行檢測多份樣品中的多種獸藥殘留，且檢測靈敏度達到了歐盟和國家殘留限量的要求，檢測結果與確證方法相比有很好的符合率。
    中國成功申辦2008年北京奧運會后，時任國務院副總理的李嵐清于2001年9月先后兩次就國產化興奮劑檢測生物芯片裝置的開發工作做出了專門批示。2001年11月，博奧生物聯合清華大學、國家體育總局興奮劑檢測中心等機構，在程京博士的帶領下，正式啟動了高通量興奮劑檢測蛋白芯片項目的研發工作。博奧生物基于芯片平臺的興奮劑檢測技術可在一片芯片上同時對16種違禁藥物進行檢測，具有通量高、速度快、成本低和操作簡單的優勢，解決了現有方法檢測費用過于昂貴、檢測人力需求巨大等問題，可以最終實現運動員大規模的篩查。2005年3月，英國NatureMethods雜志在其科研亮點專欄名為《生物芯片——奧林匹克的希望》的文章中指出，“生物芯片北京國家工程研究中心(暨博奧生物)研制的新型、高通量興奮劑檢測蛋白芯片正在成為反興奮劑斗爭中的有力武器。”
    此外，博奧生物還在臨床檢測、芯片教學等諸多應用領域開發出了相應的整體解決方案，他們都可以與自主研制的激光共焦掃描儀相結合，從芯片熒光掃描圖像直接給出檢測結果并生成報表，無需人為統計數據和計算。
    程京表示：“這樣的整體系統，充分考慮到了顧客的需求和便捷，同時在技術上有很大提高。與傳統設備相比，我們的檢測速度可提高5倍。” 
中國應發展自己的生命科學儀器工業
    談及我國今后生物芯片領域的發展，程京認為：“中國是時候，也有能力發展自己的生命科學儀器工業。”他說：“以前我們在儀器設備方面做的很少，主要是小打小鬧做點試劑盒什么的。863實施過程中很大一部分經費，都用來購買了國外的設備，這對中國來講是個很危險的信號。一旦受到國外的限制，將給我國帶來很大的威脅，因此很多東西都應該自己做。”
    說到自己的產品，他顯得信心十足：“其實現在我國已經具備了做這些儀器和設備的能力，而且做的時候完全可以有一些創新。我們已經出口的產品，如激光掃描儀，在同類產品中，我們是相當的。跟同一檔次的產品比，我們是數一數二，即便跟價格超過我們數倍的產品比，我們在性能上也不比他們差，因此我們現在很有信心。”但他認為，政府還應加大支持力度：“要逐步樹立消費者對國產品牌的信心，政府應該加大力度進行引導。